Metode (Svibanj 2020)

Brzo i precizno ispravljanje pogrešaka amplikona piro posljedica pomoću akacije

Brzo i precizno ispravljanje pogrešaka amplikona piro posljedica pomoću akacije

teme Bioinformatika Mikrobne zajednice Nizanje Uredniku: Metode mikrobne raznolikosti temeljene na sekvenciranju amplikona visoke propusnosti kompromitirane su greškama u čitanju. Roche 454 GS FLX Titanovo pirovikcionisanje trenutno je najčešće korištena tehnologija za studije mikrobioloških zajednica temeljenih na amplikonu, unatoč visokim stopama pogreške umetanja-brisanja povezanih u homopolimerima 1, 2 . Trenutn

Kvantificiranje lokalne rezolucije krio-EM karata gustoće

Kvantificiranje lokalne rezolucije krio-EM karata gustoće

teme Krioelektronska mikroskopija Obrada slike proteini Softver Sažetak Predlažemo definiciju lokalne razlučivosti za trodimenzionalne elektronske krio-mikroskopske (krio-EM) karte gustoće koja koristi lokalne sinusoidne značajke. Naš algoritam nema slobodnih parametara i primjenjiv je na ostale modalitete snimanja, uključujući tomografiju. Procje

Vizualizacija podataka: dvosmislenost kao suvozača

Vizualizacija podataka: dvosmislenost kao suvozača

teme Bioinformatika Računalna biologija i bioinformatika Biti siguran da je dobro; biti nesiguran nije nužno loše. Istraživački timovi rade na vizualnom prikazu neizvjesnosti. Glavni Podaci iz eksperimenta mogu izgledati solidno. Nakon daljnjeg ispitivanja, podaci se mogu pretvoriti u nešto manje čvrsto. Reakc

ProteomeBinders: planiranje europskog resursa afiniteta za analizu ljudskog proteoma

ProteomeBinders: planiranje europskog resursa afiniteta za analizu ljudskog proteoma

Ispravljanje ovog članka objavljeno je 01. veljače 2007 Ovaj je članak ažuriran ProteomeBinders je novi europski konzorcij koji ima za cilj uspostaviti sveobuhvatan resurs dobro karakteriziranih afinitetnih reagensa, uključujući, ali ne ograničavajući se na antitijela, za analizu ljudskog proteoma. S obzi

Dodatak: Istraživanje odrednica sekvence amiloidne strukture pomoću ljestvica matrica za određivanje položaja

Dodatak: Istraživanje odrednica sekvence amiloidne strukture pomoću ljestvica matrica za određivanje položaja

teme Skupljanje proteina Redoslijed proteina Proteome informatika Izvorni članak objavljen je 14. veljače 2010 Nat. Metode 7 , 237–242 (2010); objavljeno na mreži 14. veljače 2010; dodatak objavljen nakon tiska 29. rujna 2010. Nakon objave našeg rada u tablici 1 utvrdili smo pogrešku u odnosu na usporedbu našeg programa, Waltza, s 3D profilom programa 1 (ref. 25 u na

Plazmidi: kupovina u doba obilja

Plazmidi: kupovina u doba obilja

teme Citološke tehnike Funkcionalna genomika Solarne ćelije Tehnologija Upravljanje, dijeljenje i kontrola kvalitete plazmida može biti jednostavno. No, mnoge tehnike njihovog širenja ne povećavaju se, što vodi neprofitnim organizacijama i kompanijama da istražuju nove mogućnosti. Glavni Postoji mnogo načina da se "kupuju" za plazmide, ekstrahromosomsku, kružnu DNK koja se nalazi u bakterijama i nekim eukariotskim stanicama. Plazmidi

Što je manje, to je bolje

Što je manje, to je bolje

Biologe sve više zanimaju pristupi s jednim molekulima. U ovom broju, Focus pruža biološkom vodiču za ovo relativno novo područje, a dva rada prikazuju napredak u nanoskalijskoj vizualizaciji. Posjetite methagora da biste vidjeli i objavili komentare na ovaj članak. Sposobnost analize bioloških sustava na razini jedno-molekula otvara putove istraživanja koji nisu mogući primjenom tehnika za mjerenje agregatnih svojstava molekularne populacije. Ova nov

Ispravljanje: Točna identifikacija jednostrukih nukleotidnih varijanti u pojedinačnim stanicama koje su amplificirane na cijeli genom

Ispravljanje: Točna identifikacija jednostrukih nukleotidnih varijanti u pojedinačnim stanicama koje su amplificirane na cijeli genom

Izvorni članak objavljen je 20. ožujka 2017 Nat. Metode 14 , 491–493 (2017); objavljeno na mreži 20. ožujka 2017; ispravljeno nakon ispisa 13. listopada 2017 U verziji ovog članka koji je u početku objavljen, Lodato, MA i sur . Science 350 , 94–98 (2015) (referenca 2) naveden je kao primjer jednogodijelnog istraživanja sekvenciranja s visokim prijelazima CG u TA koji primjenjuje toplinsku lizu. Međutim,

Proizvodi Thermo Scientific omogućuju primjenu najsuvremenijih matičnih stanica

Proizvodi Thermo Scientific omogućuju primjenu najsuvremenijih matičnih stanica

Sažetak Thermo Scientific matična ćelija izvrsnosti uključuje mnoge proizvode koji su neophodni za uspješno istraživanje matičnih stanica. Korišteni od strane istraživača za podršku vrhunskim aplikacijama u laboratorijima širom svijeta, proizvodi u portfelju Stem Cell Excellence pružaju točnost i pouzdanost koja su potrebna za podršku ovom revolucionarnom istraživačkom području. Ovdje ćemo opisa

Mikroskopija: pregled kroz tkivo

Mikroskopija: pregled kroz tkivo

teme Stanična neuroznanost Fluorescentno snimanje Tehnologija Uzorci tkiva raspršuju svjetlost i isključuju dublji pogled. Sredstva za čišćenje tkiva su to promijenila, ali znanstvenici moraju razmotriti optimizaciju optike prilikom upotrebe ovih metoda. Glavni Da bi proučio uzroke srčanih udara, njemački anatom Werner Spalteholz razvio je način da srčano tkivo postane prozirno mješavinom benzil-alkohola i metil-salicilata. Na izložbi

Ispravljanje: Masovno paralelna mutageneza s jednom aminokiselinom

Ispravljanje: Masovno paralelna mutageneza s jednom aminokiselinom

Izvorni članak objavljen je 05. siječnja 2015 Nat. Metode 12 , 203–206 (2015); objavljeno na mreži 5. siječnja 2015; ispravljeno nakon ispisa 10. travnja 2017 U inačici ovog članka koja je prvotno objavljena, jedinica (nM) koncentracije dUTP opisana u odjeljku "Priprema predložaka divljeg tipa" internetskih metoda nije bila točna. Ispravna

Inteligentno dizajniran odgovor

Inteligentno dizajniran odgovor

Sve je vjerojatnije da će se znanstvenici raspravljati o mitu o inteligentnom dizajnu kao znanstvenoj teoriji. Posjetite methagora da biste vidjeli i objavili komentare na ovaj članak. Nešto više od godinu dana prije nego što slavimo dvjestogodišnjicu Darwinovog rođenja, anti-darvinski aktivizam je živ i zdrav. Najzlo

Microfluidics: u potrazi za ubojitom aplikacijom

Microfluidics: u potrazi za ubojitom aplikacijom

Tvrtke i akademski istraživači razvijaju sve više mikrofluidnih uređaja. Ali ono što tehnološki dionici doista žele jest aplikacija koja će pokrenuti široko prihvaćanje mikrofluidike od strane biologa. Izvještava Nathan Blow. Polje mikrofluidika sada je na mjestu gdje se traži potraga za "aplikacijom ubojice" - ili "aplikacijom ubojice", kako bi rekli računalni ljudi. Tijekom pos

Male RNA-e: novi svijet biologije

Male RNA-e: novi svijet biologije

Mali napori na otkrivanju i profiliranju RNK dramatično su preoblikovali temeljne koncepte regulacije gena i vode do novih alata za proučavanje genskih funkcija. Sposobnost dvolančane RNK da utišava gene prvi je put opisana u Caenorhabditis elegans 1998. - otkriće kojim bi Andrew Fire i Craig Mello zaslužili Nobelovu nagradu za fiziologiju ili medicinu 2006. godi

Bušenje u velikim podacima o genomu raka

Bušenje u velikim podacima o genomu raka

teme Bioinformatika Genomika raka Asfaltiranje cesta kroz podatkovne planine, konzorciji razvijaju tijekove rada i alate za široku upotrebu. Glavni Genetičar raka Matthew Meyerson, koji djeluje na Dana-Farber Institutu za rak i Širokom institutu MIT i Harvardu, prati brojne načine kako tumori stvaraju kaos u urednim stanicama. Že

Brza, visokopropusna biblioteka priprema za slijeđenje sljedeće generacije

Brza, visokopropusna biblioteka priprema za slijeđenje sljedeće generacije

teme Kemijske knjižnice Sljedeće generacije Sažetak Napredak u sekvenciranju nove generacije doveo je do novih metoda pripreme biblioteke kompatibilnih s više platformi za sekvenciranje. Postojeće metode (i mehaničke i enzimske) suočavaju se s ograničenjima: protokoli u više koraka, gubitak uzorka, nedostatak automatizacije i troškovi rada. S kontin

Mikrobiologija: postizanje najboljih pristranosti PCR-a

Mikrobiologija: postizanje najboljih pristranosti PCR-a

teme Metagenomics Microbiome Tehnike temeljene na PCR-u Mnogi čimbenici mogu zataškati rezultate široko korištene tehnike pojačanja za analizu mikrobioma, ali istraživači pronalaze strategije kako doći do istine. Glavni Zamislite da držite čašu vode koja puze mikrobi - i to je dobra stvar, jer provodite popis bezbrojnih mikroskopskih stanovnika jezera iz kojih ste dobili tu vodu. Ali kako

Mali dišni put na čipu omogućuje analizu upale pluća i reakcije na lijekove in vitro

Mali dišni put na čipu omogućuje analizu upale pluća i reakcije na lijekove in vitro

teme citokini Lab-na-a-chip Disanje Translacijska istraživanja Sažetak Ovdje smo opisali razvoj ljudskog pluća 'mali dišni put na čipu' koji sadrži diferencirani, mukocilijarni bronhiolarni epitel i temeljni mikrovaskularni endotel koji doživljava protok tekućine, što omogućava analizu patofiziologije pluća na nivou organa in vitro . Izloženos

Mjera obnovljivosti

Mjera obnovljivosti

teme Biološke tehnike Podaci istraživanja Jasna ideja uspješnosti bioloških istraživačkih metoda - ali i granice - presudna je za stvaranje pouzdanih podataka koje drugi mogu reproducirati. Biti u stanju ponoviti i nadograditi se na radima drugih znanstvenika ili prilagoditi nečije ideje ako podaci sugeriraju drugačije, dio je temelja koji podržava znanstveni proces. Ali s o

Gdje su podaci?

Gdje su podaci?

teme Objavljivanje Nature Methods sada zahtijeva da se izjave o dostupnosti podataka dobiju s istraživačkim radovima. Dok istraživačka zajednica prihvaća razmjenu podataka, akademski časopisi mogu dati svoj dio pomoći. Od ovog mjeseca svi istraživački radovi koji su prihvaćeni za objavljivanje u časopisu Nature , Nature Methods i 11 drugih Nature naslova bit će potrebni kako bi sadržavali informacije o tome mogu li i kako čitatelji pristupiti temeljnim podacima. Ove će izjav

Označavanje proteina proteina in vivo

Označavanje proteina proteina in vivo

teme Proteom Proteomska analiza proteomika Alvarez-Castelao, B. i sur . Nat. Biotehnologiji. 35 , 1196–1201 (2017). Metode za označavanje novo sintetiziranih proteina omogućavaju istraživačima da izvade proteine ​​iz stanica za identifikaciju pomoću tehnika poput masne spektrometrije. Mutirani metionin-tRNA sintetaza (MetRS) omogućava da se metionin tRNA napuni s neprirodnim analognim aminokiselinama azidonorleucinom, koji sadrži bioorthogonalni dio koji se može označiti klikom kemije ručkom za pročišćavanje. Kombinacijom ove

Ispravljanje: Uporedna vizualizacija odnosa genotipa i fenotipa

Ispravljanje: Uporedna vizualizacija odnosa genotipa i fenotipa

Izvorni članak objavljen je 30. srpnja 2015 Nat. Metode 12 , 698–699 (2015); objavljeno na mreži 30. srpnja 2015; ispravljeno nakon ispisa 24. rujna 2015 U inačici ovog članka koja je prvotno objavljena izostavljen je izvor financiranja. Autori priznaju dodatna sredstva od Medicinskog vijeća za istraživanje (program MC_U142684171). Pogreš

Spremanje DNK i RNA u suhom stanju, sobna temperatura

Spremanje DNK i RNA u suhom stanju, sobna temperatura

Sažetak Voda skraćuje rok trajanja DNK. Integritet biosampa je upitan za uzorke pohranjene u vlažnom okruženju zbog postojanog rizika hidrolize DNK, čak i na niskoj temperaturi. GenVault je razvio skup proizvoda koji uključuje GenPlates ™, GenSolve ™, GenTegra ™ cijevi i GenConnect ™ za pohranu i upravljanje biosamplama suhim i na sobnoj temperaturi (25 ° C). GenVault preu

Masena spektrometrija: igra dohvaća

Masena spektrometrija: igra dohvaća

Masena spektrometrija više je nego ikad na prvom mjestu funkcionalnih istraživanja proteomike. Tehnologija je prešla dug put, ali što je budućnost? Nathan Blow dobiva perspektive, predviđanja i želje ključnih programera. „Ono što smo vidjeli u proteklom desetljeću uglavnom su bila poboljšanja postojećih tehnologija, “ kaže Franz Hillenkamp sa Sveučilišta u Munsteru. John Yates iz Scr

'Grubi vodič' za objavu

'Grubi vodič' za objavu

Slanje ili ponovno predavanje rukopisa - neki važni koraci i odluke na tom putu. Posjetite methagora da biste vidjeli i objavili komentare na ovaj članak. Put do objave za neke je znanstvenike dobro prevladao, ali drugima izgleda više kao mračan, neoznačen put. Pomaže znati što možete očekivati ​​od stručne recenzije (pogledajte našu redakciju u svibnju 2006.), ali često s

Masena spektrometrija za biologe

Masena spektrometrija za biologe

teme Masovna spektrometrija proteomika Proteomika koja se temelji na masnoj spektrometriji i dalje se brzo širi, ne samo u pogledu metoda i instrumenata, već i bioloških pitanja. Carol Robinson prvi je put koristila masni spektrometar kao tinejdžer u ranim 1970-ima. Sjeća se visokih napona, opasnosti i uzbuđenja. &quo

Izvori varijacije

Izvori varijacije

teme Podaci istraživanja Statističke metode Sažetak Da bismo generalizirali zaključke populacije, moramo uzorkovati njezinu varijaciju. Glavni Promjenjivost je neizbježna u eksperimentima i zbog bioloških i tehničkih učinaka. Dok tehničku varijabilnost treba strogo kontrolirati kako bi se poboljšala unutarnja valjanost rezultata, neke vrste biološke varijabilnosti moraju se održati kako bi se omogućila generalizacija rezultata za populaciju koja je od interesa. Eksperiment

Humanizirana fenotipska platforma za provjeru kronične boli

Humanizirana fenotipska platforma za provjeru kronične boli

teme Kronične boli Fenotipska probir Sažetak Censo biotehnologija i Cellectricon udružili su snage kako bi razvili prvu u vrsti humaniziranu platformu za otkrivanje lijekova za ciljanje kronične boli. Platforma se temelji na ljudskim induciranim pluripotentnim neuronima dobivenim matičnim stanicama u kombinaciji sa Cellectriconovim sustavom probira Cellaxess ® Elektra. Komb

Strukturna genomika u središtu pažnje

Strukturna genomika u središtu pažnje

Napori strukturne genomike pokrenuli su kontinuirani razvoj novih metoda i tehnologija, koristi širokoj zajednici. Posjetite methagora da biste vidjeli i objavili komentare na ovaj članak. Jedno od mnogih područja istraživanja koje je započelo brzi početak projekata na genomima jest područje poznato kao strukturna genomika, visokopropusni napor rješavanja trodimenzionalnih proteinskih struktura. Trenut

Pogreška: imunoPET za cijelo tijelo otkriva aktivnu SIV dinamiku u makakama tretiranim viremičnim i antiretrovirusnim terapijama

Pogreška: imunoPET za cijelo tijelo otkriva aktivnu SIV dinamiku u makakama tretiranim viremičnim i antiretrovirusnim terapijama

Izvorni članak objavljen je 09. ožujka 2015 Nat. Metode 12 , 427–432 (2015); objavljeno na mreži 9. ožujka 2015 .; ispravljeno nakon ispisa 11. lipnja 2015. godine U verziji ovog članka, prvobitno objavljenom, ime Emmeline L. Blanchard pogrešno je napisano kao Emeline. Pogreška je ispravljena u HTML i PDF verziji članka. autori P

Akademska provjera prolazi kroz visoku propusnost

Akademska provjera prolazi kroz visoku propusnost

teme Poslovanje i industrija Screening visoke propusnosti Znanstvena zajednica Stvaranje učinkovitih ekrana zahtijeva vrijeme, skepticizam i pronicljivi kompromis. Istraživači u akademskim skrining centrima stvaraju analize za projekte kojih se velike farmaceutske tvrtke nerado dotiču. Primjerice, poticaj za skrining centar na Sveučilištu Dundee u Škotskoj stigao je od znanstvenika koji su otkrili obećavajuće ciljeve lijekova, ali nisu mogli zainteresirati komercijalne partnere u programima liječenja parazitskih infekcija u svijetu u razvoju. Dok indu

Objektivna usporedba metoda praćenja čestica

Objektivna usporedba metoda praćenja čestica

teme Fluorescentno snimanje Obrada slike Mikroskopija Sažetak Praćenje čestica je od ključnog značaja za kvantitativnu analizu unutarćelijskih dinamičkih procesa iz podataka mikroskopske slike s vremenom lapse. Budući da ručno otkrivanje i praćenje velikog broja pojedinih čestica nije izvedivo, mnoge su skupine razvile automatizirane računske metode za te zadatke. U cilju iz

Distribucija uzoraka i bootstrap

Distribucija uzoraka i bootstrap

teme Podaci istraživanja Sažetak Pojasni sustav može se koristiti za procjenu nesigurnosti procjena uzoraka. Glavni Prethodno smo razgovarali o važnosti procjene nesigurnosti u našim mjerenjima i uključenja u analizu podataka 1 . Da bismo znali u kojoj mjeri možemo općenito generalizirati svoja zapažanja, moramo znati kako se naša procjena razlikuje u različitim uzorcima i je li pristrana (sustavno precjenjivanje ili podcjenjivanje prave vrijednosti). Nažalost,

Znači pišete rad

Znači pišete rad

teme Objavljivanje Pisanje jasnog, točnog i uvjerljivog znanstvenog rada ujedno je i umjetnost i vještina. To je jedan vrijedan savladavanja. U sedamnaestom stoljeću, početkom povijesti moderne eksperimentalne znanosti, otkrića su obično distribuirana unutar samo odabrane skupine (S. Shapin, A Social History of Truth , Univ. Chic

Istraživanje HUPO test uzorka otkriva uobičajene probleme u proteomici temeljenoj na masnoj spektrometriji

Istraživanje HUPO test uzorka otkriva uobičajene probleme u proteomici temeljenoj na masnoj spektrometriji

Ispravljanje ovog članka objavljeno je 01. srpnja 2009 Ovaj je članak ažuriran Sažetak Proveli smo ispitivanje uzorka testa kako bismo pokušali identificirati pogreške koje dovode do neuporedivosti, uključujući nepotpunost uzorkovanja peptida, u tekućinskoj kromatografiji i proteomskoj osnovi masne spektrometrije. U 27 la

Screening: starost riba

Screening: starost riba

teme Slike Microfluids screening zebraste ribice Napredak mikrofluidike i snimanja, u kombinaciji s nekim visokim studijama, povećava interes za probir cijelog organizma. Randall Peterson nije upisao diplomski studij planirajući raditi sa zebrama. Umjesto toga, pokušao je razumjeti kako imunosupresivni lijek rapamycin utječe na mTOR, njegov protein protein sisavca, za koji je sada poznato da integrira stanične signalne puteve koji kontroliraju sve, od stanične pokretljivosti do sinteze proteina. U mj

Ispravljanje: Iskorištavanje tercijarne strukture kroz lokalne nabora za kristalografsko postupno postupanje

Ispravljanje: Iskorištavanje tercijarne strukture kroz lokalne nabora za kristalografsko postupno postupanje

Izvorni članak objavljen je 15. rujna 2013 Nat. Metode 10 , 1099–1101 (2013); objavljeno na mreži 15. rujna 2013 .; ispravljeno nakon ispisa 5. svibnja 2014 U prvobitno objavljenoj verziji, autori nisu priznali sve ljude koji su sudjelovali u stvaranju kristalografskog skupa podataka AF1503 iz A. fu

AlphaLISA imunoeseji: alternativa ELISA-ima bez pranja za istraživanje i otkriće lijekova

AlphaLISA imunoeseji: alternativa ELISA-ima bez pranja za istraživanje i otkriće lijekova

Sažetak PerkinElmerovi imunotesti bazirani na zrncu AlphaLISA ® dizajnirani su za otkrivanje analita u biološkim uzorcima. Ovi kemiluminescentni testovi bez pranja idealni su za minijaturizaciju i automatizaciju. Oni pokazuju izuzetnu osjetljivost, širok dinamički raspon i robusne performanse koje se uspoređuju s uobičajenim enzimsko-imunorbentnim testom (ELISA). Glavn

Proteinski inženjering: kretanje između slučajnosti i razloga

Proteinski inženjering: kretanje između slučajnosti i razloga

teme Kemijske knjižnice Proteinski inženjering Istraživači koriste velike knjižnice, usmjerene knjižnice i racionalni dizajn da bi osmislili korisne proteine. Tehnologija proteina korištena je za stvaranje antitijela, vrlo svijetlih fluorescentnih proteina i enzima koji smanjuju otrovni otpad. Genen

Optimizirana metoda pripreme biblioteke za sekvenciranje sljedeće generacije

Optimizirana metoda pripreme biblioteke za sekvenciranje sljedeće generacije

Sažetak Pojava slijeđenja sljedeće generacije omogućila je analizu genoma u prethodno nedostižnoj dubini. Roche, Illumina i Life Technologies, među ostalim, razvili su dobro uspostavljene platforme za duboko sekvenciranje. Bez obzira na instrument, jedno od uskih grla za sljedeće generacije je vrijeme i resursi potrebni za pripremu predloška i knjižnica. Ovdje s

Kritička procjena tumačenja metagenoma - mjerilo softvera za metagenomiju

Kritička procjena tumačenja metagenoma - mjerilo softvera za metagenomiju

teme Razvrstavanje i taksonomija Računalna biologija i bioinformatika Metagenomics Sažetak Metode sastavljanja, taksonomsko profiliranje i kombiniranje su ključne za interpretaciju metagenomskih podataka, ali nedostatak konsenzusa o vrednovanju otežava ocjenu uspješnosti. Izazov kritičke procjene interpretacije metagenoma (CAMI) angažirao je globalnu zajednicu programera za usporedbu njihovih programa na vrlo složenim i realističnim skupovima podataka, generiranim od newly 700 novo sekvenciranih mikroorganizama i novel 600 novih virusa i plazmida, što predstavlja uobičajena eksperimentalna post

Pogreška: Praćenje strukturne dinamike proteina u otopini pomoću vremenski razlučenog širokokutnog raspršivanja rendgenskih zraka

Pogreška: Praćenje strukturne dinamike proteina u otopini pomoću vremenski razlučenog širokokutnog raspršivanja rendgenskih zraka

Izvorni članak objavljen je 21. rujna 2008 Nat. Metode 5 , 881–886 (2008); objavljeno na mreži 21. rujna 2008 .; ispravljeno nakon ispisa 29. rujna 2008. U verziji ovog članka, prvobitno objavljenom, vremenska skala iznesena u slici 2d legende je netočna. Ispravna vremenska skala trebala bi biti 3 μs. Uz to

Matične stanice: modeli bolesti koji pokazuju i govore

Matične stanice: modeli bolesti koji pokazuju i govore

teme Stanična kultura Ciljanje gena Inducirane pluripotentne matične stanice Reporterski geni Znanstvena zajednica Matične stanice Sažetak Kombinacija tehnika uređivanja gena s induciranim pluripotentnim matičnim stanicama je i moćno i teško. Glavni Stanice su izgledale predivno - i to je bila loša vijest, prisjeća se Clive Svendsen, istraživač matičnih stanica i neurobiolog iz Medicinskog centra Cedars-Sinai. Razvijao je

Usredotočite se na mapiranje mozga

Usredotočite se na mapiranje mozga

teme Slike Neuroznanost Vizualizacija funkcionalne povezanosti u moždanom korteksu čovjeka na temelju podataka magnetske rezonance. Slika mozga Joachima Böttgera i Daniela Marguliesa (Institut Max Planck za ljudske kognitivne i mozak znanosti, Leipzig, Njemačka) u skladateljskoj pomoći Tobiasa S. Hof

Masena spektrometrija za kromatinsku biologiju

Masena spektrometrija za kromatinsku biologiju

teme kromatina Histonska analiza Masovna spektrometrija Da bi otkrili nove znakove histona i interakcije, istraživači se okreću sofisticiranim instrumentima proteomike. Glavni Istražitelji koji namjeravaju probiti jedan kod mogu previdjeti drugi. Tako smo u danima kada se vjerovalo da samo DNA slijed drži sve stanične tajne, histoni, bjelančevine bjelančevina koje uništavaju DNK, odbačene kao malo više od pasivnog materijala za pakiranje. Sada se t

Slijedeći žice

Slijedeći žice

Erratum na ovaj članak objavljen je 01. siječnja 2008 Znanstvenici su možda konačno razvili tehnike za rekonstrukciju kompletnih dijagrama ožičenja za neuronski krug ljudskog mozga. Izvještava Nathan Blow. U 1880-im Santiago Ramón y Cajal počeo je ispitivati ​​strukturu ljudskog mozga na staničnoj razini. Više od 100

Znanstvenik i pametni telefon

Znanstvenik i pametni telefon

teme Matematika i računarstvo Mobilne računalne platforme poput iPhonea počinju upadati u laboratorij - ozbiljna perspektiva ili bajka? Posjetite methagora da biste vidjeli i objavili komentare na ovaj članak. Nekada su se telefoni koristili isključivo za razgovor s drugim ljudima, a računala su koristila softverske aplikacije. Raču

De novo sastavljanje genoma: ono što svaki biolog treba znati

De novo sastavljanje genoma: ono što svaki biolog treba znati

teme Bioinformatika Algoritmi za sastavljanje genoma Kako se sve više genoma sastavlja od nule, znanstvenici se bore da ocijene i poboljšaju njihovu kvalitetu. Glavni Na pitanje koliko je zrelo polje sastavljanja genoma, Ian Korf sa Sveučilišta u Kaliforniji, Davis, uspoređuje ga s tinejdžerom s velikim sposobnostima. &quo

Ispravljanje: Uporedna analiza metoda slijedanja RNA za degradirane ili s malim unosom uzoraka

Ispravljanje: Uporedna analiza metoda slijedanja RNA za degradirane ili s malim unosom uzoraka

teme Redoslijed RNA transkriptomika Izvorni članak objavljen je 19. svibnja 2013 Nat. Metode 10 , 623–629 (2013); objavljeno na mreži 19. svibnja 2013; ispravljeno nakon 2. prosinca 2013 U verziji ovog članka, prvobitno objavljenom, u odjeljku Online metode „Knjižnice RNase H“, rečenica koja počinje s „Dodali smo 5 μl prethodno zagrijanu RNase H ....“ trebala j

Alati za neuroznanost: uvidi u mozak

Alati za neuroznanost: uvidi u mozak

Istraživači u dva centra za neuroznanost sa sjedištem u Bostonu rade na razvoju novih alata i tehnologija za obradu slike u nadi da će otkriti tajne načina na koji mozak funkcionira. Tijekom tjedna neuroznanstvenica sa Sveučilišta Harvard Randy Buckner nekoliko puta putuje između svoja dva ureda u Bostonu, jedan u Martinos Centru za biomedicinsko snimanje u Charlestownu, a drugi preko rijeke u Cambridgeu, na glavnom kampusu Sveučilišta Harvard. U Centru

Povlačenje: Neočekivane mutacije nakon uređivanja CRISPR-Cas9 in vivo

Povlačenje: Neočekivane mutacije nakon uređivanja CRISPR-Cas9 in vivo

Izvorni članak objavljen je 30. svibnja 2017. godine Nat. Metode 14 , 547–548 (2017); objavljeno na mreži 30. svibnja 2017; ažurirano online 14. lipnja 2017 .; ispravljeno na mreži 25. srpnja 2017 .; povučeno 30. ožujka 2018. godine Ovaj je članak povučen jer se genomske varijante koje su autori primijetili kod dva miša tretirana CRISPR-om ne mogu u potpunosti pripisati CRISPR-Cas9. Rad je bi

Neparametrijski testovi

Neparametrijski testovi

teme Podaci istraživanja Statističke metode Ispravljanje ovog članka objavljeno je 27. lipnja 2014 Ovaj je članak ažuriran Neparametrijski testovi čvrsto uspoređuju skenirane ili rangirane podatke. Vidjeli smo da je t -test čvrst u odnosu na pretpostavke o normalnosti i ekvivalentnosti 1 , pa je stoga široko primjenjiv. Postoji

Pozivanje sljedeće generacije reagensa za afinitet

Pozivanje sljedeće generacije reagensa za afinitet

teme Generacija antitijela Kemijski alati Život u laboratoriju Tehnologija Kao nadopuna antitijela, novi reagensi za ciljanje proteina pozivaju široke vrste eksperimenata. Glavni Kad bi se samo reagensi poput antitijela izravnali, bili stabilni dugi niz godina, svestrani, obnovljivi i jeftini i omogućili znanstvenicima da istražuju niz proteina odjednom. Ov

Usporedba uzoraka - dio I

Usporedba uzoraka - dio I

teme Objavljivanje Podaci istraživanja Statističke metode Čvrsta usporedba parova neovisnih ili srodnih uzoraka zahtijeva različite pristupe t- testu. Među najčešćim vrstama pokusa su komparativna ispitivanja koja uspoređuju ishod u različitim uvjetima kao što su muško naspram ženskog, placebo protiv lijeka ili prije u odnosu na liječenje. Analiza ovih

Grupiranje

Grupiranje

teme Iskopavanje podataka Obrada podataka Klasteriranje pronalazi uzorke u podacima - bili oni tamo ili ne. Mnoge biološke analize uključuju podjele uzoraka ili varijabli u klastere na temelju sličnosti ili obratne udaljenosti. Na primjer, u studiji genske ekspresije mogli bismo tražiti podskupine bolesnika sa sličnom ekspresijom ili koristiti komplementarni pristup i identificirati slične eksprimirane gene kod pacijenata. Klas

Samostojeća verzija SENSOLUX®: neinvazivno određivanje pH i DO u tikvicama

Samostojeća verzija SENSOLUX®: neinvazivno određivanje pH i DO u tikvicama

Sažetak Određivanje kinetičkih parametara rasta tijekom ranog razvoja procesa je od presudne važnosti. Što se više podataka dobije, to se više strategija optimizacije može primijeniti za stvaranje visoko produktivnih staničnih linija. Nova SENSOLUX ® tehnologija omogućuje optičko i neinvazivno mjerenje pH i zasićenja otopljenim kisikom u tikvicama. Ova tehnolo

Dobar sudac

Dobar sudac

teme Biološke tehnike Objavljivanje Suci pružaju neprocjenjivu uslugu u unapređivanju znanosti. Nudimo malo hrane za razmišljanje o tome kako učinkovito recenzirati članke o metodama recenzije. Kao sudac, znate da prosuđivati ​​tuđi rad nije lako i treba mnogo vremena i brige. Kao autor, vjerojatno ste vidjeli da kvaliteta izvješća sudaca može jako varirati. Kao urednici,

Kvantitativna slikovna citometrija: instrumentacija izbora za automatiziranu staničnu i tkivnu analizu

Kvantitativna slikovna citometrija: instrumentacija izbora za automatiziranu staničnu i tkivnu analizu

teme Stanično snimanje Protok citometrija Sažetak Laserska skenirajuća citometrija (LSC) tehnologija je izbora za automatiziranu, kvantitativnu analizu visokog protoka s visokim protokom heterogenih staničnih uzoraka i uzoraka tkiva. LSC dopunjava protočnu citometriju, omogućava analizu uzoraka pričvršćenih na čvrste podloge, poput adhezivnih stanica i uzoraka tkiva. Također